1、科目不一。菠萝蜜是荨麻目桑科波罗蜜属常绿乔木，而榴莲是锦葵目木棉科，榴莲属一种巨型的热带常绿乔木。2、外表不一。榴莲果皮坚实，密生三角形刺，钉是长而尖果肉是由假种皮的肉包组成，肉色淡黄；菠萝蜜果实成熟时表皮呈黄褐色，表面有瘤状凸体和粗毛。3、大小不一。菠萝蜜的外形比榴莲大一些。榴莲果实每个约有4至8斤重。菠萝蜜是世界上最重的水果，一般重达5-20斤。
菠萝蜜垂直分布一般在海拔300米以下。需要高温、潮湿，无霜的气候，适生于年平均气揾在22-24℃以上，最冷月平均气温不低于12℃，绝对低温不低于0℃，积温在7500℃以上，年降雨量1200-1800毫米的地区。
榴莲蜜生长于海拔500米左右的森林中，气候特征是全年分布的高降雨量和可能的周期性洪水。为典型的热带果树，特别适宜在高气温地区种植。与菠萝蜜相比，榴莲蜜耐寒能力较差，适宜的年均温为24-25.4℃。
菠萝蜜椭圆形或倒卵形，长7-15厘米或更长，宽3-7厘米，先端钝或渐尖，基部楔形，成熟之叶全缘。花雌雄同株，花序生老茎或短枝上，雄花序有时着生于枝端叶腋或短枝叶腋。聚花果椭圆形至球形，或不规则形状，幼时浅黄色，成熟时黄褐色，表面有坚硬六角形瘤状凸体和粗毛。
榴莲蜜形态为简单的椭圆形卵形，具有整个边缘和尖的顶点。从树干或短枝叶上的分枝上的单生单性花序，雄性花序是3-5厘米长和1厘米直径的圆柱状总状花序，具有微黄色花。
果实在7-10厘米长的花序梗上。每粒果实15-100粒，卵形稍扁平，呈浅棕色，周围有绿色，黄色或橙色的肉质假种皮。
